مطالعه in silico خانواده ژنی پلی‌آمین اکسیداز (PAO) در انگور

پلی­ آمین اکسیدازها (PAO) آنزیم­های وابسته به فلاوین آدنین دی­نوکلئوتید هستند که در کاتابولیسم پلی­آمین­ها در پراکسی­ زوم، آپوپلاست و سیتوپلاسم نقش دارند. گزارش­های زیادی در زمینه اهمیت ژن­های PAO گیاهان در پاسخ به تنش­ها ارائه شده است با این حال مطالعه جامعی در مورد تعداد، روابط تکاملی، ساختار ژنی و الگوی بیانی ژن­های PAO در انگور موجود نیست. در مطالعه حاضر با استفاده از روش­های بیوانفورماتیکی، هشت ژن محتمل PAO (VvPAO1-VvPAO8) در ژنوم انگور 12X شناسایی شد. بر اساس مطالعه فیلوژنتیکی ژن­های VvPAO به سه گروه تقسیم می­شوند که هر گروه از نظر جایگاه سلولی و کارکرد اختصاصی است. ژن­های VvPAO دارای صفر تا 9 اینترون می‌باشند و بر روی 6 کروموزوم از 19 کروموزوم انگور قرار گرفته ­اند. وجود چندین عنصر تنظیمی cis پاسخ به تنش­ها و هورمون­ها در پیشبر این ژن­ها دلالت بر نقش احتمالی آن­ها در پاسخ به تنش­ها دارد. بررسی داده­ های ریزآرایه ژن­های اورتولوگ PAO انگور در آرابیدوپسیس در شرایط تنش­های غیر زیستی نشان داد که سطح رونویسی این ژن­ها در پاسخ به تنش­های غیر زیستی افزایش می­یابد که نشان دهنده نقش این ژن­ها در پاسخ انگور به تنش­ها است. نتایج این مطالعه داد­های پایه برای پژوهش­های بیشتر در مورد نقش ژن­های PAO در انگور را فراهم می­سازد.